Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
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