Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC3□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC3□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC3□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC3□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC3□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC3□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC3□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC3□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC3□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC3□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC3□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC3□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.3 ms