Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
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