Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.1 ms