Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
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NFIXQ14938 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NFIXQ14938 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
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