Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
TUBA3CQ13748 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
TUBA3CQ13748 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TUBA3CQ13748 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TUBA3CQ13748 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TUBA3CQ13748 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
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