Protein–RNA interactions for Protein: Q13501

SQSTM1, Sequestosome-1, humanhuman

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQSTM1Q13501 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
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