Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
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