Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
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