Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TRDNQ13061 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
TRDNQ13061 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
TRDNQ13061 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TRDNQ13061 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TRDNQ13061 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TRDNQ13061 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TRDNQ13061 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TRDNQ13061 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
TRDNQ13061 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TRDNQ13061 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TRDNQ13061 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TRDNQ13061 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
TRDNQ13061 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TRDNQ13061 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TRDNQ13061 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TRDNQ13061 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TRDNQ13061 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.42□□□□□ -2.18
TRDNQ13061 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
TRDNQ13061 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
TRDNQ13061 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TRDNQ13061 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TRDNQ13061 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TRDNQ13061 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TRDNQ13061 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
TRDNQ13061 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TRDNQ13061 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TRDNQ13061 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TRDNQ13061 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TRDNQ13061 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TRDNQ13061 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
TRDNQ13061 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
TRDNQ13061 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
TRDNQ13061 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC1.42□□□□□ -2.18
TRDNQ13061 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
TRDNQ13061 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC1.42□□□□□ -2.18
TRDNQ13061 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TRDNQ13061 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TRDNQ13061 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TRDNQ13061 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TRDNQ13061 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
TRDNQ13061 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TRDNQ13061 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TRDNQ13061 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TRDNQ13061 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TRDNQ13061 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TRDNQ13061 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TRDNQ13061 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TRDNQ13061 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TRDNQ13061 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TRDNQ13061 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TRDNQ13061 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TRDNQ13061 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TRDNQ13061 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
TRDNQ13061 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TRDNQ13061 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TRDNQ13061 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TRDNQ13061 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TRDNQ13061 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
TRDNQ13061 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TRDNQ13061 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TRDNQ13061 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TRDNQ13061 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TRDNQ13061 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TRDNQ13061 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC1.4□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.39□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TRDNQ13061 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
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