Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
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FOXO1Q12778 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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FOXO1Q12778 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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FOXO1Q12778 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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FOXO1Q12778 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXO1Q12778 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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