Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CACNB1Q02641 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CACNB1Q02641 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CACNB1Q02641 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CACNB1Q02641 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CACNB1Q02641 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CACNB1Q02641 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CACNB1Q02641 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CACNB1Q02641 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CACNB1Q02641 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CACNB1Q02641 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CACNB1Q02641 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CACNB1Q02641 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CACNB1Q02641 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CACNB1Q02641 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CACNB1Q02641 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CACNB1Q02641 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CACNB1Q02641 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
CACNB1Q02641 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.4
CACNB1Q02641 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CACNB1Q02641 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.1 ms