Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
RPS29P62273 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
RPS29P62273 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC-0.67□□□□□ -2.52
RPS29P62273 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC-0.67□□□□□ -2.52
RPS29P62273 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
RPS29P62273 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
RPS29P62273 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
RPS29P62273 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
RPS29P62273 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
RPS29P62273 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
RPS29P62273 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
RPS29P62273 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
RPS29P62273 NUCB2-202ENST00000458064 1279 ntTSL 1 (best) BASIC-0.67□□□□□ -2.52
RPS29P62273 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
RPS29P62273 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC-0.67□□□□□ -2.52
RPS29P62273 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
RPS29P62273 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
RPS29P62273 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
RPS29P62273 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
RPS29P62273 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
RPS29P62273 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
RPS29P62273 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
RPS29P62273 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
RPS29P62273 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
RPS29P62273 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
RPS29P62273 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC-0.68□□□□□ -2.52
RPS29P62273 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
RPS29P62273 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
RPS29P62273 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
RPS29P62273 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
RPS29P62273 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
RPS29P62273 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
RPS29P62273 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
RPS29P62273 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
RPS29P62273 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
RPS29P62273 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
RPS29P62273 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
RPS29P62273 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
RPS29P62273 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
RPS29P62273 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
RPS29P62273 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
RPS29P62273 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
RPS29P62273 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
RPS29P62273 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
RPS29P62273 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
RPS29P62273 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
RPS29P62273 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
RPS29P62273 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
RPS29P62273 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
RPS29P62273 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
RPS29P62273 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
RPS29P62273 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
RPS29P62273 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
RPS29P62273 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
RPS29P62273 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
RPS29P62273 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
RPS29P62273 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
RPS29P62273 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
RPS29P62273 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
RPS29P62273 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
RPS29P62273 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
RPS29P62273 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
RPS29P62273 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
RPS29P62273 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
RPS29P62273 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
RPS29P62273 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
RPS29P62273 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
RPS29P62273 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
RPS29P62273 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
RPS29P62273 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
RPS29P62273 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.69□□□□□ -2.52
RPS29P62273 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.69□□□□□ -2.52
RPS29P62273 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
RPS29P62273 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
RPS29P62273 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
RPS29P62273 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
RPS29P62273 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
RPS29P62273 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
RPS29P62273 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
RPS29P62273 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
RPS29P62273 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
RPS29P62273 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
RPS29P62273 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC-0.7□□□□□ -2.52
RPS29P62273 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC-0.7□□□□□ -2.52
RPS29P62273 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC-0.7□□□□□ -2.52
RPS29P62273 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
RPS29P62273 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
RPS29P62273 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
RPS29P62273 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
RPS29P62273 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC-0.71□□□□□ -2.52
RPS29P62273 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
RPS29P62273 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
RPS29P62273 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
RPS29P62273 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
RPS29P62273 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
RPS29P62273 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
RPS29P62273 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
RPS29P62273 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
RPS29P62273 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
RPS29P62273 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 214.3 ms