Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TRHP20396 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TRHP20396 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TRHP20396 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TRHP20396 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TRHP20396 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TRHP20396 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TRHP20396 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TRHP20396 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TRHP20396 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TRHP20396 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TRHP20396 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TRHP20396 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TRHP20396 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TRHP20396 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TRHP20396 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TRHP20396 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TRHP20396 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRHP20396 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRHP20396 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRHP20396 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRHP20396 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRHP20396 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRHP20396 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRHP20396 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TRHP20396 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TRHP20396 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TRHP20396 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRHP20396 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TRHP20396 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TRHP20396 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TRHP20396 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRHP20396 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRHP20396 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRHP20396 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRHP20396 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRHP20396 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
TRHP20396 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
TRHP20396 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
TRHP20396 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TRHP20396 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
TRHP20396 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TRHP20396 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TRHP20396 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TRHP20396 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TRHP20396 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TRHP20396 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TRHP20396 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TRHP20396 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TRHP20396 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TRHP20396 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TRHP20396 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TRHP20396 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TRHP20396 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TRHP20396 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TRHP20396 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TRHP20396 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TRHP20396 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TRHP20396 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TRHP20396 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TRHP20396 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TRHP20396 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TRHP20396 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TRHP20396 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TRHP20396 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TRHP20396 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TRHP20396 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TRHP20396 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TRHP20396 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TRHP20396 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TRHP20396 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TRHP20396 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TRHP20396 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TRHP20396 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TRHP20396 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TRHP20396 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TRHP20396 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TRHP20396 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TRHP20396 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TRHP20396 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TRHP20396 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TRHP20396 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TRHP20396 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TRHP20396 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TRHP20396 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRHP20396 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRHP20396 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TRHP20396 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRHP20396 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRHP20396 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRHP20396 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRHP20396 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TRHP20396 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRHP20396 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TRHP20396 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRHP20396 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TRHP20396 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRHP20396 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TRHP20396 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRHP20396 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
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