Protein–RNA interactions for Protein: O43196

MSH5, MutS protein homolog 5, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSH5O43196 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
MSH5O43196 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
MSH5O43196 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
MSH5O43196 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
MSH5O43196 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
MSH5O43196 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
MSH5O43196 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
MSH5O43196 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
MSH5O43196 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
MSH5O43196 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
MSH5O43196 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
MSH5O43196 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
MSH5O43196 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
MSH5O43196 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
MSH5O43196 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
MSH5O43196 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
MSH5O43196 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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MSH5O43196 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
MSH5O43196 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
MSH5O43196 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
MSH5O43196 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
MSH5O43196 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
MSH5O43196 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
MSH5O43196 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
MSH5O43196 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
MSH5O43196 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
MSH5O43196 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
MSH5O43196 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
MSH5O43196 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
MSH5O43196 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
MSH5O43196 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
MSH5O43196 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
MSH5O43196 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
MSH5O43196 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
MSH5O43196 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
MSH5O43196 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
MSH5O43196 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
MSH5O43196 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
MSH5O43196 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
MSH5O43196 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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MSH5O43196 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
MSH5O43196 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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MSH5O43196 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
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MSH5O43196 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
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MSH5O43196 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
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MSH5O43196 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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MSH5O43196 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MSH5O43196 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MSH5O43196 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
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MSH5O43196 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MSH5O43196 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
MSH5O43196 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
MSH5O43196 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
MSH5O43196 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MSH5O43196 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
MSH5O43196 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
MSH5O43196 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MSH5O43196 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
MSH5O43196 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
MSH5O43196 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
MSH5O43196 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
MSH5O43196 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
MSH5O43196 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
MSH5O43196 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
MSH5O43196 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
MSH5O43196 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
MSH5O43196 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
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