Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C9orf78Q9NZ63 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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