Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
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FOXQ1Q9C009 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
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FOXQ1Q9C009 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
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FOXQ1Q9C009 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
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FOXQ1Q9C009 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
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