Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ1

ERGIC2, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC2Q96RQ1 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms