Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Q1T7F1 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Q1T7F1 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC0.68□□□□□ -2.3
Q1T7F1 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC0.68□□□□□ -2.3
Q1T7F1 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
Q1T7F1 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Q1T7F1 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Q1T7F1 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Q1T7F1 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Q1T7F1 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC0.68□□□□□ -2.3
Q1T7F1 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Q1T7F1 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC0.68□□□□□ -2.3
Q1T7F1 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
Q1T7F1 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Q1T7F1 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Q1T7F1 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Q1T7F1 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
Q1T7F1 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
Q1T7F1 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Q1T7F1 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Q1T7F1 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
Q1T7F1 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Q1T7F1 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
Q1T7F1 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Q1T7F1 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Q1T7F1 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Q1T7F1 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.68□□□□□ -2.3
Q1T7F1 AC007204.1-201ENST00000621794 555 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Q1T7F1 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Q1T7F1 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Q1T7F1 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Q1T7F1 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
Q1T7F1 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.3
Q1T7F1 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Q1T7F1 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Q1T7F1 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Q1T7F1 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Q1T7F1 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Q1T7F1 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Q1T7F1 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Q1T7F1 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Q1T7F1 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
Q1T7F1 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Q1T7F1 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Q1T7F1 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC0.67□□□□□ -2.3
Q1T7F1 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Q1T7F1 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC0.67□□□□□ -2.3
Q1T7F1 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Q1T7F1 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
Q1T7F1 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Q1T7F1 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
Q1T7F1 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Q1T7F1 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
Q1T7F1 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Q1T7F1 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Q1T7F1 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Q1T7F1 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
Q1T7F1 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC0.67□□□□□ -2.3
Q1T7F1 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Q1T7F1 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
Q1T7F1 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Q1T7F1 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Q1T7F1 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.3
Q1T7F1 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC0.67□□□□□ -2.3
Q1T7F1 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Q1T7F1 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
Q1T7F1 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC0.67□□□□□ -2.3
Q1T7F1 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
Q1T7F1 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Q1T7F1 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Q1T7F1 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
Q1T7F1 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
Q1T7F1 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Q1T7F1 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Q1T7F1 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Q1T7F1 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Q1T7F1 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Q1T7F1 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Q1T7F1 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Q1T7F1 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
Q1T7F1 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Q1T7F1 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Q1T7F1 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.3
Q1T7F1 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Q1T7F1 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Q1T7F1 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Q1T7F1 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Q1T7F1 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Q1T7F1 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Q1T7F1 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Q1T7F1 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Q1T7F1 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Q1T7F1 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Q1T7F1 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Q1T7F1 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
Q1T7F1 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Q1T7F1 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC0.66□□□□□ -2.3
Q1T7F1 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC0.66□□□□□ -2.3
Q1T7F1 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
Q1T7F1 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
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