Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
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PTPROQ16827 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPROQ16827 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPROQ16827 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPROQ16827 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPROQ16827 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPROQ16827 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPROQ16827 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPROQ16827 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPROQ16827 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPROQ16827 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPROQ16827 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPROQ16827 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
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PTPROQ16827 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
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PTPROQ16827 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
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PTPROQ16827 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
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PTPROQ16827 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPROQ16827 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPROQ16827 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPROQ16827 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
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PTPROQ16827 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPROQ16827 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
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