Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.3 ms