Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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