Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SMAD1Q15797 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
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