Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TRIP4Q15650 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TRIP4Q15650 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
TRIP4Q15650 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TRIP4Q15650 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TRIP4Q15650 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TRIP4Q15650 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TRIP4Q15650 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TRIP4Q15650 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TRIP4Q15650 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TRIP4Q15650 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TRIP4Q15650 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TRIP4Q15650 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TRIP4Q15650 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TRIP4Q15650 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TRIP4Q15650 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TRIP4Q15650 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TRIP4Q15650 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TRIP4Q15650 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TRIP4Q15650 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TRIP4Q15650 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TRIP4Q15650 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TRIP4Q15650 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TRIP4Q15650 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TRIP4Q15650 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
TRIP4Q15650 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
TRIP4Q15650 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
TRIP4Q15650 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
TRIP4Q15650 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TRIP4Q15650 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TRIP4Q15650 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TRIP4Q15650 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
TRIP4Q15650 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRIP4Q15650 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRIP4Q15650 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRIP4Q15650 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRIP4Q15650 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRIP4Q15650 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRIP4Q15650 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRIP4Q15650 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRIP4Q15650 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRIP4Q15650 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRIP4Q15650 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRIP4Q15650 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRIP4Q15650 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRIP4Q15650 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRIP4Q15650 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRIP4Q15650 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRIP4Q15650 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRIP4Q15650 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRIP4Q15650 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRIP4Q15650 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRIP4Q15650 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRIP4Q15650 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRIP4Q15650 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRIP4Q15650 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRIP4Q15650 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRIP4Q15650 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRIP4Q15650 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRIP4Q15650 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRIP4Q15650 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRIP4Q15650 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRIP4Q15650 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRIP4Q15650 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRIP4Q15650 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.2 ms