Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms