Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PDCD1Q15116 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PDCD1Q15116 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PDCD1Q15116 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PDCD1Q15116 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PDCD1Q15116 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PDCD1Q15116 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PDCD1Q15116 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PDCD1Q15116 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PDCD1Q15116 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PDCD1Q15116 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PDCD1Q15116 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PDCD1Q15116 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PDCD1Q15116 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PDCD1Q15116 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PDCD1Q15116 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PDCD1Q15116 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PDCD1Q15116 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PDCD1Q15116 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PDCD1Q15116 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PDCD1Q15116 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PDCD1Q15116 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PDCD1Q15116 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PDCD1Q15116 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PDCD1Q15116 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PDCD1Q15116 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PDCD1Q15116 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PDCD1Q15116 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PDCD1Q15116 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PDCD1Q15116 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PDCD1Q15116 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PDCD1Q15116 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PDCD1Q15116 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PDCD1Q15116 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PDCD1Q15116 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PDCD1Q15116 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PDCD1Q15116 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PDCD1Q15116 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PDCD1Q15116 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PDCD1Q15116 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PDCD1Q15116 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PDCD1Q15116 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PDCD1Q15116 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PDCD1Q15116 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PDCD1Q15116 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PDCD1Q15116 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PDCD1Q15116 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PDCD1Q15116 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PDCD1Q15116 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PDCD1Q15116 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PDCD1Q15116 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PDCD1Q15116 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PDCD1Q15116 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PDCD1Q15116 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PDCD1Q15116 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PDCD1Q15116 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PDCD1Q15116 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PDCD1Q15116 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PDCD1Q15116 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
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