Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PEX6Q13608 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.2 ms