Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC0.74□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC0.74□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC0.73□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC0.72□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC0.72□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC0.72□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.72□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
KRR1Q13601 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
KRR1Q13601 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
KRR1Q13601 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
KRR1Q13601 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
KRR1Q13601 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
KRR1Q13601 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
KRR1Q13601 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
KRR1Q13601 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
KRR1Q13601 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.71□□□□□ -2.3
KRR1Q13601 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
KRR1Q13601 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
KRR1Q13601 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
KRR1Q13601 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
KRR1Q13601 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
KRR1Q13601 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
KRR1Q13601 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
KRR1Q13601 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC0.71□□□□□ -2.3
KRR1Q13601 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
KRR1Q13601 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
KRR1Q13601 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
KRR1Q13601 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
KRR1Q13601 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
KRR1Q13601 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
KRR1Q13601 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
KRR1Q13601 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
KRR1Q13601 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC0.71□□□□□ -2.3
KRR1Q13601 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.71□□□□□ -2.3
KRR1Q13601 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.7□□□□□ -2.3
KRR1Q13601 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
KRR1Q13601 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
KRR1Q13601 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
KRR1Q13601 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
KRR1Q13601 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
KRR1Q13601 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
KRR1Q13601 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
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