Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ATRQ13535 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ATRQ13535 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ATRQ13535 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
ATRQ13535 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ATRQ13535 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ATRQ13535 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
ATRQ13535 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
ATRQ13535 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
ATRQ13535 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.39
ATRQ13535 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC0.09□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.39
ATRQ13535 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
ATRQ13535 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
ATRQ13535 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
ATRQ13535 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
ATRQ13535 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
ATRQ13535 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
ATRQ13535 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
ATRQ13535 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ATRQ13535 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ATRQ13535 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ATRQ13535 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ATRQ13535 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ATRQ13535 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.4
ATRQ13535 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ATRQ13535 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC0.09□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ATRQ13535 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
ATRQ13535 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ATRQ13535 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC0.09□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ATRQ13535 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ATRQ13535 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ATRQ13535 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ATRQ13535 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ATRQ13535 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ATRQ13535 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ATRQ13535 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ATRQ13535 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ATRQ13535 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ATRQ13535 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ATRQ13535 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ATRQ13535 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ATRQ13535 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ATRQ13535 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ATRQ13535 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ATRQ13535 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ATRQ13535 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ATRQ13535 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC0.08□□□□□ -2.4
ATRQ13535 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ATRQ13535 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ATRQ13535 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
ATRQ13535 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ATRQ13535 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC0.08□□□□□ -2.4
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ATRQ13535 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
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ATRQ13535 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
ATRQ13535 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC0.08□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ATRQ13535 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
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ATRQ13535 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ATRQ13535 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.07□□□□□ -2.4
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