Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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PRPF4BQ13523 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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