Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
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