Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
MKRN4PQ13434 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
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