Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC2.1□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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RPA4Q13156 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.07□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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