Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.68□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC1.67□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC1.67□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
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IFT88Q13099 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
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