Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
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CSTF3Q12996 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
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CSTF3Q12996 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
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CSTF3Q12996 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
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CSTF3Q12996 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
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CSTF3Q12996 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
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CSTF3Q12996 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
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CSTF3Q12996 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
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CSTF3Q12996 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
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