Protein–RNA interactions for Protein: P48645

NMU, Neuromedin-U, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMUP48645 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NMUP48645 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NMUP48645 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NMUP48645 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
NMUP48645 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NMUP48645 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NMUP48645 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NMUP48645 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NMUP48645 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
NMUP48645 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NMUP48645 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NMUP48645 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NMUP48645 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NMUP48645 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NMUP48645 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NMUP48645 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NMUP48645 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
NMUP48645 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
NMUP48645 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
NMUP48645 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
NMUP48645 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NMUP48645 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NMUP48645 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NMUP48645 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NMUP48645 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NMUP48645 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.15
NMUP48645 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NMUP48645 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NMUP48645 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NMUP48645 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
NMUP48645 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
NMUP48645 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NMUP48645 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NMUP48645 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
NMUP48645 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
NMUP48645 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
NMUP48645 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
NMUP48645 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NMUP48645 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NMUP48645 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NMUP48645 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NMUP48645 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
NMUP48645 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NMUP48645 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NMUP48645 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NMUP48645 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NMUP48645 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NMUP48645 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NMUP48645 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NMUP48645 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NMUP48645 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC1.58□□□□□ -2.16
NMUP48645 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
NMUP48645 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NMUP48645 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NMUP48645 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NMUP48645 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
NMUP48645 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
NMUP48645 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NMUP48645 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NMUP48645 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NMUP48645 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
NMUP48645 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
NMUP48645 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NMUP48645 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
NMUP48645 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NMUP48645 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NMUP48645 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NMUP48645 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NMUP48645 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
NMUP48645 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NMUP48645 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NMUP48645 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NMUP48645 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NMUP48645 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NMUP48645 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NMUP48645 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
NMUP48645 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
NMUP48645 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
NMUP48645 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
NMUP48645 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NMUP48645 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NMUP48645 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NMUP48645 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NMUP48645 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC1.57□□□□□ -2.16
NMUP48645 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
NMUP48645 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NMUP48645 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NMUP48645 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
NMUP48645 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
NMUP48645 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
NMUP48645 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NMUP48645 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NMUP48645 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NMUP48645 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NMUP48645 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NMUP48645 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NMUP48645 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NMUP48645 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NMUP48645 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NMUP48645 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.5 ms