Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.21□□□□□ -2.05
LRRTM2O43300 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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