Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.8 ms