Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.4 ms