Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVS0

C1orf140, Putative uncharacterized protein C1orf140, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf140Q5VVS0 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC0.66□□□□□ -2.3
C1orf140Q5VVS0 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
C1orf140Q5VVS0 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
C1orf140Q5VVS0 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
C1orf140Q5VVS0 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
C1orf140Q5VVS0 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
C1orf140Q5VVS0 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
C1orf140Q5VVS0 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
C1orf140Q5VVS0 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC0.66□□□□□ -2.3
C1orf140Q5VVS0 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
C1orf140Q5VVS0 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
C1orf140Q5VVS0 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
C1orf140Q5VVS0 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
C1orf140Q5VVS0 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
C1orf140Q5VVS0 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
C1orf140Q5VVS0 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
C1orf140Q5VVS0 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
C1orf140Q5VVS0 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
C1orf140Q5VVS0 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.66□□□□□ -2.3
C1orf140Q5VVS0 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
C1orf140Q5VVS0 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
C1orf140Q5VVS0 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
C1orf140Q5VVS0 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
C1orf140Q5VVS0 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
C1orf140Q5VVS0 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
C1orf140Q5VVS0 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
C1orf140Q5VVS0 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
C1orf140Q5VVS0 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
C1orf140Q5VVS0 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
C1orf140Q5VVS0 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
C1orf140Q5VVS0 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
C1orf140Q5VVS0 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.66□□□□□ -2.3
C1orf140Q5VVS0 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
C1orf140Q5VVS0 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.3
C1orf140Q5VVS0 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.65□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC0.65□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC0.65□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC0.65□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC0.65□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC0.65□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC0.65□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.7 ms