Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
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CCDC142Q17RM4 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
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