Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC0.63□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC0.62□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.61□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC0.61□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.6□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC0.6□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC0.6□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
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