Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.44□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GABRA6Q16445 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.1 ms