Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

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Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
EXT1Q16394 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
EXT1Q16394 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
EXT1Q16394 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
EXT1Q16394 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
EXT1Q16394 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
EXT1Q16394 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
EXT1Q16394 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
EXT1Q16394 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
EXT1Q16394 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
EXT1Q16394 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
EXT1Q16394 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
EXT1Q16394 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
EXT1Q16394 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
EXT1Q16394 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
EXT1Q16394 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
EXT1Q16394 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
EXT1Q16394 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
EXT1Q16394 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
EXT1Q16394 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
EXT1Q16394 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
EXT1Q16394 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
EXT1Q16394 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
EXT1Q16394 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
EXT1Q16394 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
EXT1Q16394 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
EXT1Q16394 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
EXT1Q16394 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
EXT1Q16394 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
EXT1Q16394 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
EXT1Q16394 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
EXT1Q16394 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
EXT1Q16394 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
EXT1Q16394 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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EXT1Q16394 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
EXT1Q16394 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
EXT1Q16394 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
EXT1Q16394 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
EXT1Q16394 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
EXT1Q16394 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
EXT1Q16394 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
EXT1Q16394 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
EXT1Q16394 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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EXT1Q16394 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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EXT1Q16394 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
EXT1Q16394 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
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EXT1Q16394 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
EXT1Q16394 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
EXT1Q16394 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
EXT1Q16394 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
EXT1Q16394 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
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