Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SS18Q15532 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SS18Q15532 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SS18Q15532 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SS18Q15532 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SS18Q15532 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SS18Q15532 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SS18Q15532 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SS18Q15532 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SS18Q15532 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SS18Q15532 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SS18Q15532 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SS18Q15532 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SS18Q15532 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
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SS18Q15532 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SS18Q15532 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SS18Q15532 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SS18Q15532 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SS18Q15532 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SS18Q15532 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SS18Q15532 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SS18Q15532 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
SS18Q15532 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SS18Q15532 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SS18Q15532 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SS18Q15532 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SS18Q15532 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SS18Q15532 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SS18Q15532 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SS18Q15532 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SS18Q15532 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SS18Q15532 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SS18Q15532 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SS18Q15532 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SS18Q15532 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
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SS18Q15532 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SS18Q15532 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SS18Q15532 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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SS18Q15532 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SS18Q15532 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SS18Q15532 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
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SS18Q15532 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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SS18Q15532 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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SS18Q15532 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SS18Q15532 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SS18Q15532 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SS18Q15532 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
SS18Q15532 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
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SS18Q15532 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SS18Q15532 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SS18Q15532 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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SS18Q15532 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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SS18Q15532 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SS18Q15532 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SS18Q15532 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SS18Q15532 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SS18Q15532 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SS18Q15532 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SS18Q15532 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SS18Q15532 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SS18Q15532 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SS18Q15532 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SS18Q15532 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SS18Q15532 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SS18Q15532 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SS18Q15532 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SS18Q15532 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SS18Q15532 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SS18Q15532 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SS18Q15532 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SS18Q15532 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SS18Q15532 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SS18Q15532 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SS18Q15532 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SS18Q15532 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
SS18Q15532 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SS18Q15532 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SS18Q15532 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SS18Q15532 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SS18Q15532 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SS18Q15532 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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