Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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NKX1-1Q15270 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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NKX1-1Q15270 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
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NKX1-1Q15270 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
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