Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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PTPRRQ15256 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
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PTPRRQ15256 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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PTPRRQ15256 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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PTPRRQ15256 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
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