Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.01
HERC3Q15034 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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HERC3Q15034 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
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HERC3Q15034 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
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HERC3Q15034 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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HERC3Q15034 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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HERC3Q15034 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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HERC3Q15034 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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HERC3Q15034 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
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