Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NR1I3Q14994 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.3 ms