Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
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SCARB2Q14108 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
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SCARB2Q14108 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
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SCARB2Q14108 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
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SCARB2Q14108 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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